گروه طالبان در استان‌هایی که جمعیت اهل تشیع در آن‌ها زیاد است، مدارس دینی ویژه اهل سنت از جمله مدارس دینی «جهادیه» می‌سازند.

در استان‌های هزاره‌نشین افغانستان، مردم محلی به دلیل اینکه طالبان به ساخت مدرسه در این مناطق اهمیتی نمی‌دهند، با بودجه شخصی‌ و اعطای زمین و پول مدرسه‌سازی می‌کنند. در همین حال، با اینکه در استان‌های بامیان، سرپل و دایکندی جمعیت اهل تشیع و هزاره‌ها بالا است، طالبان به ساخت مدارس دینی در این استان‌ها تمرکز کرده‌اند. 

وزارت معارف طالبان ماه گذشته اعلام کرده بود که در سال ۱۴۰۴، بیش از ۱۹ میلیون افغانی کمک مردمی برای توسعه زیرساخت‌های مدارس در سرپل جمع‌ شده است. این وزارتخانه هفته قبل نیز اعلام کرد که مردم شهرستان میرامور استان دایکندی بیش از یک میلیون افغانی را برای ساختمان جدید مدرسه ده غوچی هزینه کرده‌اند و ساخت این مدرسه آغاز شده است.

وزارت معارف طالبان در حال افزایش شمار مدارس دینی زیرمجموعه این وزارتخانه است و ساخت و توسعه این مدارس را در مناطق شیعه‌نشین یا در نزدیکی این مناطق دنبال می‌کند. این وزارتخانه دوشنبه ۲۴ فروردین (۱۳ آوریل) اعلام کرد که کار احداث ساختمان جدید مدرسه دینی «فرقانیه» در استان سرپل به هزینه ۵۰۰ هزار افغانی آغاز شده است. 

این وزارتخانه حدود یک هفته قبل هم سنگ بنای مدرسه دینی و مرکز حفظ قرآن در منطقه غوروچی شهرستان سیغان استان بامیان را گذاشت. 

مدارس جهادی طالبان که در آن‌ها آموزش دینی بر مبنای برداشت‌های افراطی این گروه ارائه می‌شود، در استان‌های بامیان، دایکندی و سرپل نیز آغاز به کار کرده‌اند و اکنون طلبه‌های دینی در این مراکز مشغول  تحصیل‌اند. 

رژیم طالبان در تلاش برای ترویج مذهب حنفی در سطح افغانستان است و ساخت و گسترش مدارس دینی در طول چهار سال و نیم گذشته جزو اولویت‌های حکومت طالبان بوده است. 

طالبان در مناطق با جمعیت زیاد اهل تشیع هم تمام مقام‌های دولتی را پیروان اهل سنت منصوب کرده‌اند. مقام‌های محلی طالبان در این مناطق علاوه بر اداره ساختارهای دولتی، مراسم‌ مذهبی خود را برگزار می‌کنند و هم‌زمان مذهب اهل سنت را تبلیغ می‌کنند و مانع برگزاری مراسم و فعالیت‌های مذهبی اهل تشیع می‌شوند. 

رژیم طالبان هم بر مساجد و مدارس دینی اهل سنت و هم اهل تشیع، کنترل شدید دارد و از منابر این مساجد برای تبلیغ استفاده می‌کند. آموزش فقه جعفری هم از دانشگاه‌های افغانستان حذف شده و امور حکومتداری و قضایی رژیم طالبان بر اساس اصول فقه حنفی انجام می‌شود. 

رژیم طالبان حتی اجرای مراسم مذهبی اهل تشیع در افغانستان را هم محدود کرده‌اند. جامعه اهل تشیع افغانستان به دلیل اینکه در دوران جنگ طالبان با حکومت پیشین افغانستان، نیرویی در صفوف طالبان نداشتند، در ساختار کنونی که تمامی امور حکومت در دست فرماندهان، نیروها و هواداران طالبان است، در حاشیه قرار گرفته‌اند. هرچند رژیم طالبان به چند عضو شیعه خود‌ــ البته نه در بخش‌های نظامی، امنیتی و استخباراتی‌ـ‌ـ مناصبی را واگذار کرده‌اند، حقوق اهل تشیع افغانستان در حکومت طالبان عموما نادیده گرفته شده‌ است. 

رژیم طالبان جو سرکوب و اختناق شدید در افغانستان اعمال کرده‌اند و این وضعیت باعث شده است که جامعه اهل تشیع افغانستان به‌ منظور جلوگیری از افزایش فشار بیشتر طالبان، از اعتراض علیه این گروه خودداری کند. با همه این‌ها، ساخت مساجد و مدارس دینی و ترویج ایدئولوژی طالبان همچنان در کانون توجه رژیم طالبان قرار دارد و در طول چهار سال و نیم گذشته، بیشتر از آنکه در افغانستان مدرسه ساخته شود، مسجد و مدرسه دینی ساخته شده است.